Desde el año 2013 que entró en funcionamiento el Instituto Nacional de Salud del Niño San Borja se realizó 19,555 intervenciones quirúrgicas, alcanzando una capacidad operativa del 100% en las 12 salas de operaciones, logro que fue destacado en el marco del Día de la Cirugía Peruana.

 El INSN San Borja rindió un homenaje especial a los 90 médicos cirujanos de la institución que día a día salvan la vida de niños y adolescentes, reafirmando su compromiso con los pacientes y su don de servicio.

 Cabe destacar que en el INSN San Borja se realizan entre 300 a 400 cirugías al mes, entre cirugías cardiovascular, neurocirugía, pediátrica, quemados, traumatología, plástica, cabeza y cuello, tórax, odontología, ginecología, oftalmología, otorrinolaringología, urología y trasplante. El mayor número de intervenciones se concretaron en la Sub Unidad Neonatal Pediátrica y la Sub Unidad de Quemado. 

En el año 2018 se reportó 6,252 intervenciones, lo que representa un 28% de crecimiento, en comparación al periodo 2017, que alcanzó 4,889 intervenciones.

Más del 70% de los casos complejos que se atienden en este centro son derivados de los diversos hospitales del interior del país, y el 90% son atendidos gratuitamente a través del Seguro Integral de Salud SIS.

En el último año, el INSN San Borja se consolidó como centro quirúrgico de alta complejidad realizando los primeros 9 trasplantes de riñón con donante vivo y donante cadavérico. 

El instituto también realiza intervenciones al corazón en recién nacidos con cardiopatías congénitas. A la fecha se han realizado más de 1400 cirugías cardiovasculares de mediana y gran complejidad con circulación extracorpórea a corazón abierto. 

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